故事从锦衣卫大明东厂挖掘古墓开始，大明东厂专权的年代是大明王朝最黑暗的年代，此时民不聊生，社会动荡不安，种种危机并存……　　无忧公主，出身贵胄，父亲为当朝皇叔，母亲乃江南大家闺秀，未受尘事沾染，是冰清玉洁的纯真少女。祥和、平静、幸福的生长环境造就了她天真……

明朝末年，东厂的宦官们一度权倾朝野，但是公道自在人心，随着越来越多的人团结反抗，宦官当权的局面逐渐走到了尽头。实时朝廷内斗，太子在六扇门捕神的照顾下躲避，下落不明。东厂势力大肆追捕，势要抓住太子，以夺回对朝廷的控制权。距离京城两百公里外的清河府，最近突发命案，清河府捕头冷霖被杀，死相离奇，现场除了一张诡异的怪兽图画，并无其他线索。由于死法甚是奇特恐怖，被人编成旱魃的故事相传，闹的满城惶恐。有一青年少侠冷洛锋，对于旱魃杀人的案件查的比捕快还要用心。冷洛锋是铃兰书院的学生，铃兰书院是专门为朝廷输送文武人才的学

明朝中期皇帝在内阁和东厂的胁迫下不能上朝理政，以东厂太监张鲸为首的宦官集团和内阁首辅大臣王佐为首的内阁集团争权夺势，锦衣卫大总管赵崇禧夹在两派中间保持中立，坚持忠于皇上，可是锦衣卫早已被两派安插了多名

明正德五年，东厂和锦衣卫明争暗斗，宦官当道，渐有和皇权、内阁分庭抗礼之势，官官相护，冤案无数，一时间民怨四起，民不聊生，百姓苦不堪言。锦衣卫神探陆翀与发小白晓毅、茫茫以及女扮男装的骆七携手，收集宦官罪

明朝年间，东厂督主高德海与锦衣卫镇抚使严烈率领舰队秘密出行东海，在暴风险境与蛟龙袭击中，幸得鲛人汐音相救，一行人误打误撞登上如梦如幻的蓬莱仙岛，高德海被岛上宝物利欲熏心，而严烈与天真善良的汐音则在与黑

本剧根据徐克执导的3D武侠电影《龙门飞甲》改编，延续了龙门客栈的传奇，结合了宫闱之争的秘史，既是一场刀光剑影，尔虞我诈的乱世江湖，又是一段腥血雨，勾心斗角的深宫谍影。